"코로나19 및 변이 바이러스 한 번에 검출하는 분자진단 기술 개발"
"코로나19 및 변이 바이러스 한 번에 검출하는 분자진단 기술 개발"
등온핵산증폭기술 이용 ... 37℃에서 30분 만에 신속 진단

60명 샘플 적용으로 검증 ... 민감도96.7%, 특이도 100%
  • 박민주
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  • 승인 2022.04.25 12:00
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건국대학교 박기수 교수 [사진=한국연구재단 제공]
건국대학교 박기수 교수 [사진=한국연구재단 제공]

[헬스코리아뉴스 / 박민주] 국내 연구팀이 등온핵산증폭기술을 활용해 코로나19 및 변이 바이러스를 한 번에 검출할 수 있는 분자진단 기술을 개발해 주목된다. 등온핵산증폭기술은 반복적인 온도조절 과정 없이 등온에서 표적 핵산을 증폭하는 기술이다. 

건국대학교 박기수 교수 연구팀은 변이 바이러스를 포함한 코로나바이러스, 박테리아 등을 37℃에서 30분 만에 신속 진단할 수 있는 '신규 등온핵산증폭기술(STAR)'을 개발했다고 25일 밝혔다. 

개발한 기술은 바이러스의 유무뿐만 아니라 종류 구분이 가능하다. 기존 PCR 및 등온핵산증폭기술 기반 분자진단 방법과 다르게 반응 개시 전 온도조절 과정도 필요 없다. 하나의 효소(T7 RNA 중합효소)만을 이용해 37도의 일정한 온도에서 반응이 진행되는 것도 특징이다.

연구팀은 전남대학교병원 최현정 교수 연구팀을 통해 확보된 60명의 실제 임상 샘플을 STAR에 적용해 성능을 검증했다. 그 결과, 코로나19에 대해 높은 민감도(96.7%)와 특이도(100%)를 보이는 것을 확인했다.

연구팀은 "STAR는 바이러스, 박테리아 및 암 등 다양한 핵산 바이오 마커 검출에도 활용 가능할 것으로 보인다. 유전자 진단 분야에서 시간 및 비용을 절감할 수 있는 방안을 제시했다는 데 연구 의의가 있다"며 "PCR로 대표되는 현재의 유전자 분석 기술을 대체할 수 있는 대안 기술로 활용 가능할 것"이라고 기대감을 표했다.

다만 현장에서 손쉽게 결과를 확인할 수 있는 시스템 구현을 위해 추가연구가 필요하며, 기술의 확장성 검증을 위해 다양한 핵산 바이오 마커 검출 연구가 지속적으로 이루어져야 한다는 설명이다.

이번 연구 결과는 바이오센서 분야 국제학술지 '바이오센서스 앤드 바이오일렉트로닉스(Biosensors and Bioelectronics)'에 지난 달 31일 온라인 게재됐으며, 과학기술정보통신부와 한국연구재단이 추진하는 우수신진연구사업의 지원으로 수행됐다. 

코로나19 및 변이 바이러스의 신속 검출을 위한 신규 등온핵산증폭기술의 모식도코로나19 및 변이 바이러스가 존재할 경우, 바이러스의 유전물질(RNA)은 DNA 프로브의 3-방향 접합(three-way juction)구조를 형성하고, T7 RNA 중합효소에 의한 전사반응을 진행함. 결과적으로 많은 양의 RNA 압타머가 생성되고, 이는 형광 염료와 결합하여 향상된 형광 신호를 발생하게 됨. 하나의 효소(T7 RNA 중합효소)를 이용하여 37도, 30분 반응을 통하여 타겟 유전자 마커의 분석을 완료할 수 있으며, 추가적인 표지과정 없이 저렴하고 손쉽게 DNA 프로브를 디자인하여 코로나19 및 변이 바이러스의 다중분석(multiplex analysis)이 가능함. 그림설명 및 그림제공 : 건국대학교 박기수 부교수
코로나19 및 변이 바이러스의 신속 검출을 위한 신규 등온핵산증폭기술의 모식도
코로나19 및 변이 바이러스가 존재할 경우, 바이러스의 유전물질(RNA)은 DNA 프로브의 3-방향 접합(three-way juction)구조를 형성하고, T7 RNA 중합효소에 의한 전사반응을 진행했다. 결과적으로 많은 양의 RNA 압타머가 생성되고, 이는 형광 염료와 결합하여 향상된 형광 신호를 발생한다. 하나의 효소(T7 RNA 중합효소)를 이용하여 37도, 30분 반응을 통해 타겟 유전자 마커의 분석을 완료할 수 있으며, 추가적인 표지과정 없이 저렴하고 손쉽게 DNA 프로브를 디자인하여 코로나19 및 변이 바이러스의 다중분석(multiplex analysis)이 가능했다.
[그림 설명 및 제공 : 건국대학교 박기수 부교수]
개발 기술의 유효성 검증을 위한 실제 임상샘플 분석 결과 코로나19에 감염된 환자 30명, 정상인 30명의 RNA 샘플을 이용하여 개발 기술의 유효성을 검증한 결과이며, 민감도 96.7%, 특이도 100%를 달성함. 또한, 통계분석(Two-tailed Student’s t-test)을 통하여 양성, 음성 샘플을 완전하게 판별 할 수 있었음(P 0.0001). 본 결과는 코로나19 진단의 표준방법인 RT-PCR 방법과 일치함을 확인함 (R=8393).그림설명 및 그림제공: 건국대학교 박기수 부교수
개발 기술의 유효성 검증을 위한 실제 임상샘플 분석 결과
코로나19에 감염된 환자 30명, 정상인 30명의 RNA 샘플을 이용하여 개발 기술의 유효성을 검증한 결과, 민감도 96.7%, 특이도 100%를 달성했다. 통계분석(Two-tailed Student’s t-test)을 통해 양성, 음성 샘플을 완전하게 판별할 수 있었다(P〈0.0001). 본 결과는 코로나19 진단의 표준방법인 RT-PCR 방법과 일치함을 확인했다(R=8393).
[그림 설명 및 제공: 건국대학교 박기수 부교수]

 


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